Après avoir traversé le grand palais pour trouver la Triforce du courage, un vieux sage met Link à l'épreuve. Le boss final est Dark Link, l'ombre du héros.
Le combat est à la limite du possible. Le dernier donjon est long et très difficile. Au bout il y a le combat contre Thunderbird que l'on croit être le boss final. Alors qu'on aperçoit la Triforce, le combat contre Dark Link commence. Le joueur n'a en général presque plus de barre de vie et doit se battre contre un ennemi qui se déplace et combat comme Link.
Un ennemi original qui fera d'autres apparitions plus discrètes. Dommage que le jeu soit aussi vieux car la fin est absolument géniale. La confrontation contre son double maléfique est complètement inattendue et très difficile car il ne reste en général plus beaucoup de vie
(même s'il existe un bug qui permet de le tuer sans risques).