Considéré comme le successeur de Miyamoto, Eiji Aonuma n'était au début qu'un designer, mais s'est hissé au rang de directeur de la série Zelda depuis Majora's Mask.
Né en 1963, Eiji a appris tout ce qui concerne le jeu vidéo au "Tokyo National University of Fine Arts and Music" (Université Nationale de Tokio des Beaux Arts et Musiques). Il obtient en 1989 un job chez Nintendo, et participe entre autre à l'oeuvre Ocarina of Time, puis devient directeur de Majora's Mask.
Ensuite, Zelda devient grâce à lui une longue série pleine de nouveauté. Son Zelda préféré est The Wind Waker, mais il est aussi particulièrement fier de Phantom Hourglass.